临沧市生态环境局凤庆分局生态环境监测站，前身为“凤庆县环境监测站”，创建于1999年。成立经批准文件为《凤庆县机构编制委员会关于撤销“凤庆县城乡建设环境保护局”成立“凤庆县建设局”和“凤庆县环境保护局”的通知》（凤机编字〔1999〕19号），隶属于凤庆县环境保护局，核定3名事业人员编制。2019年机构改革，根据《中共临沧市委机构编制委员会办公室关于印发临沧市生态环境局县区分局生态环境监测站机构编制方案的通知》（临编办发〔2019〕61号）要求，将“凤庆县环境监测站”更名为“临沧市生态环境局凤庆分局生态环境监测站”，隶属于临沧市生态环境局凤庆分局，并核定了10名事业编制（均为专业技术人员编制)。

临沧市生态环境局凤庆分局生态环境监测站是一家独立法人事业单位，全额依靠财政拨款运作，隶属于临沧市生态环境局凤庆分局。在业务上，接受省厅驻临沧市生态环境监测站的指导。